Los efectos adversos de este medicamento son, en general leves y transitorios, aunque en algunos casos pueden ser potencialmente graves. La incidencia aumenta considerablemente con la duración del tratamiento. Gastrointestinales: se han reportado náuseas, vómito, diarrea, dolor abdominal, alteraciones del gusto. Hematológicos: se ha reportado raramente pequeñas disminuciones en algunos indicadores hematológicos. Hipersensibilidad y piel: rash, incluyendo fotosensibilidad, urticaria, prurito, alopecia, y raramente disnea, angioedema y anafilaxis. Renales: ha habido, raramente, reporte de aumento de creatinina y urea en la sangre. En raras ocasiones se ha reportado insuficiencia renal aguda. Hepáticos: ha habido raramente reportes de elevación de bilirrubina y enzimas hepáticas. En muy raras ocasiones se ha reportado hepatitis o ictericia.
Neurológicos: dolor de cabeza. Ocasionalmente se han reportado reacciones neurológicas reversibles, en especial mareos, estados de confusión, alucinaciones, somnolencia y convulsiones, generalmente en pacientes con deterioro renal u otros factores predisponentes, y en los cuales la dosis fue exagerada o por encima de la recomendada. Alteraciones psicológicas/psiquiátricas: astenia, alucinaciones, letargo, insomnio, agresividad, depresión. Otros: Se han recibido reportes ocasionales de pérdida del cabello difusa acelerada. Dado que esta caída del pelo ha estado asociada con una amplia gama de procesos patológicos y medicamentos, la relación del
evento con la terapia con aciclovir es incierta.
Nota: El tratamiento con aciclovir debe ser suspendido inmediatamente, en el caso de que el paciente experimente algún episodio grave de vómitos, insuficiencia renal y/o convulsiones.