Los efectos adversos más comúnmente reportados tras la administración de Simeticona son los gastrointestinales, eventos que incluyen diarrea, náuseas, vómitos. Además, se ha reportado cefalea, faringitis, rinitis y otalgia tras la administración de Simeticona.
Los eventos adversos más frecuentemente descritos tras la administración de antiácidos que contienen aluminio o magnesio son constipación y diarrea. Además, se han descrito obstrucción intestinal, hiperosmolaridad y prurito.
Producto del uso prolongado de antiácidos se han reportado otros efectos adversos: disminución del colesterol LDL, hipermagnesemia, deficiencia de cobre, deficiencia de vitaminas y osteomalacia.
Se han reportado casos en donde pacientes en diálisis sometidos a tratamiento con antiácidos, experimentaron demencia. Otros reportes describen encefalopatía progresiva, confusión, convulsiones y coma tras la administración de antiácidos a pacientes con insuficiencia renal grave.