Las reacciones adversas más frecuentes con Quetiapina son: Somnolencia, mareos, sequedad bucal, astenia leve , constipación, taquicardia, hipotensión ortostática y dispepsia.
Al igual que con otros antipsicóticos se han asociado con Quetiapina síncope, síndrome neuroléptico maligno, leucopenia, neutropenia, edema periférico, hipotensión, temblor, acatisia, aumento del apetito, visión borrosa, mareo postural, pirexia, disartria, sialorrea, discinesia tardía, disfagia, leucopenia, y rash.
También se han informado con el uso de Quetiapina edema periférico, reacción anafiláctica, rinitis, eosinofilia, hipersensibilidad, aumento de los niveles de gamma-glutamil transferasa y síndrome de piernas inquietas.
El tratamiento con Quetiapina fue asociado con ligeras disminuciones relacionadas con la dosis de los niveles de hormona tiroidea , en particular T4 total y T4 libre. Las reducciones en T4 total y libre tuvieron su máximo dentro de las dos primeras dos a cuatro semanas de tratamiento con Quetiapina se asoció con una revisión de los efectos sobre T4 total y libre, independientemente de la duración del tratamiento .
Se observaron reducciones de igual magnitud en T3 total y T3 inversa solamente con las dosis más altas .Los niveles de tiroglobulina se mantuvieron sin cambios y, en general, no se observaron incrementos recíprocos en TSH. No hubo ningún indicio de que Quetiapina cause hipotiroidismo de importancia clínica.
Se han reportado casos muy raros de hiperglucemia o exacerbación de diabetes preexistente durante el tratamiento con Quetiapina.
Al igual que otros antipsicóticos la Quetiapina puede asociarse con aumento de peso, sobre todo en las primeras semanas de tratamiento.